La Universidad UTE se destaca por su infraestructura de centros de investigación especializados, que consolidan su liderazgo en la generación de conocimiento. El Centro de Investigación de Alimentos (CIAL) investiga la calidad y seguridad alimentaria, mientras que el Centro de Investigación Biomédica (CENBIO) avanza en biomedicina. El Centro de Investigación en Genética y Genómica (CIGG) se enfoca en genética y genómica, y el Centro de Investigación en Salud Pública y Epidemiología Clínica (CISPEC), junto con el Centro Cochrane, aporta a la salud pública y la epidemiología clínica, mejorando políticas y prácticas de salud.

Los grupos de investigación de la UTE impulsan el avance científico en áreas como biotecnología, ingeniería, ciencias sociales y salud. Su labor mantiene a la universidad a la vanguardia del conocimiento, promoviendo la colaboración interdisciplinaria y la transferencia de resultados aplicables. La participación en estos grupos fortalece la formación académica de los estudiantes y posiciona a la UTE como un referente en investigación y desarrollo a nivel nacional e internacional.