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La biodiversidad de la selva amazónica incluye especies de cacao poco conocidas, que constituyen recursos esenciales para las comunidades locales. Este estudio evaluó los compuestos bioactivos y la actividad antioxidante y antimicrobiana de las semillas y el mucílago de cuatro especies de cacao no tradicionales (Theobroma subincanum, T. speciosum, T. bicolor y Herrania nitida). Se analizaron las propiedades fisicoquímicas, los minerales, la vitamina C, los ácidos orgánicos, los fenólicos y los carotenoides mediante técnicas espectrofotométricas y cromatográficas.
La actividad antioxidante se midió mediante ABTS y DPPH, junto con la actividad antimicrobiana contra Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa y Streptococcus mutans, así como contra Candida albicans y Candida tropicalis. Las semillas de T. subincanum obtuvieron altos niveles de acidez titulable, magnesio, sodio, ácido siríngico, ácido clorogénico, ácido cafeico, rutina y quercetina. En contraste, el mucílago obtuvo altos niveles de calcio, ácido m-cumárico, ácido ferúlico, kaempferol, glucósido de quercetina y actividad antimicrobiana contra Streptococcus mutans. El mucílago de T. speciosum destacó en ácido málico, ácido tartárico, naringenina y capacidad antioxidante. Las semillas de T. bicolor destacaron en luteína y actividad antimicrobiana contra Staphylococcus aureus y Candida albicans, y el mucílago en hierro, potasio, vitamina C, ácido cítrico, ácido gálico y ácido 4-hidroxibenzoico, zeaxantina, β-caroteno y capacidad antioxidante según ABTS. El mucílago de H. nitida presenta un alto contenido de sólidos solubles. Estos resultados resaltan el potencial de estas especies como fuentes sostenibles de compuestos funcionales y nutracéuticos.