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Esta revisión explora el importante papel de los oligosacáridos de la leche humana (HMO). Destaca las notables propiedades de los HMO, ya que actúan como señuelos para los microbios causantes de enfermedades y evitan su adhesión al epitelio intestinal, lo que permite su expulsión del intestino. El papel de los HMO se ha investigado mediante metodologías convencionales, como cultivos celulares y experimentación con animales, lo que ha producido una comprensión significativa; sin embargo, están limitadas en su capacidad para emular con precisión las complejidades de la patología humana y evocan preocupaciones éticas. Aquí, se presentan modelos intestinales in vitro (IVGM) aplicados en estudios para dilucidar cómo los HMO dan forma a la microbiota. La mayoría de los estudios relacionados con el efecto de los HMO en la microbiota intestinal se realizan en biorreactores. Esta revisión presenta una descripción general concisa de esta tecnología de rápido avance, un análisis de costos, un examen de las aplicaciones contemporáneas y los desafíos potenciales asociados con su implementación, y propone recomendaciones para trayectorias futuras durante la próxima década.